青柠檬和黄柠檬完全是两个不同的品种，黄柠檬会随着成熟而变成黄色，但是青柠檬自始至终都是青色的。黄柠檬的表皮纹理比较粗糙，可以闻到一股浓郁的清香，而青柠檬是青色的，表皮十分光滑，有一股清淡的柠檬香气。
在营养成分上对比，青柠檬和黄柠檬基本是差不多的，只是青柠檬中的柠檬酸和维生素C含量更高，所以导致它的口感更加酸涩。
黄柠檬主要长在北方，国外也大多是黄柠檬，用在西餐上较多，有去腥和提鲜的作用，而青柠檬主要见于南方，东南亚也喜欢使用青柠檬入菜，适合他们酸、辣的口味，青柠檬由于皮薄，经常被用来制作酸味浓郁的果汁饮料。