非淋菌性尿道炎会复发，其诱因多与症状不显着、治疗不当、混合感染等因素有关。
1、症状不显著
非淋菌性尿道炎潜伏期较长，患者自觉性症状不明显，易被忽视，仅通过改善不良生活习惯，缓解表面症状，复发率较高。
2、治疗不当
非淋菌性尿道炎易反复发作，需要进行规范性治疗，由于某些原因不。就选择小诊所就诊，用药不规范，影响疗效，导致反复发作；也有部分患者治疗期间症状改善或消失，随意停药，疗程不足，病情也易复发。
3、混合感染
非淋菌性尿道炎致病菌包括：生殖支原体、真菌、沙眼衣原体、单纯疱疹病毒。大部分患者同时感染多种病原体。衣原体尿道炎混合感染者为23.4%；支原体尿道炎混合感染者为27%。仅消除一种致病菌，其他致病菌未消除，适宜条件下再次发作。
