嘴边起水泡，要根据发病的原因采取相应的处理方法。上火所致可以应用清热去火的药物治疗；单纯疱疹病毒感染，则需要口服以及外用抗病毒的药物；若为天疱疮，则需应用糖皮质激素类药物治疗。
若嘴边起水泡是由于上火造成的，可以多喝些温开水，同时也要服用清热去火的药物来治疗，如牛黄上清丸、牛黄解毒丸、金银花颗粒等。服用这些药物后，体内的火气会逐渐被消除，改善上火引起的起水泡等症状。
若嘴边的水泡经常复发，考虑是单纯疱疹病毒感染引起的，可以口服抗病毒的药物来治疗，如伐昔洛韦片、泛昔洛韦片、阿昔洛韦片等，服药后可以有效缩短病程。也可以在局部外涂具有抗病毒效果的药物，如喷昔洛韦乳膏、阿昔洛韦乳膏、重组干扰素凝胶等。
嘴边起水泡也可能是患上了天疱疮，这种水泡的疱壁松弛，破溃之后会形成糜烂面，需要口服糖皮质激素类药物来治疗，如醋酸泼尼松片、地塞米松片、甲泼尼龙片等。同时还需要外用糖皮质激素类药膏，如曲安奈德益康唑乳膏、地塞米松乳膏、丙酸氟替卡松软膏等。